Un modo per identificare un geode non aperto è sapere quali aree sono in grado di contenerle. I geodi si presentano in formazioni sedimentarie e ignee, come calcare e flussi di basalto. Quando le rocce madri si consumano, i geodi vengono depositati nell'area circostante. Un geode non aperto ha una corteccia esterna che rende difficile distinguerlo dalle altre rocce, ma è di forma sferica, che va da perfettamente rotondo a oblungo.
I geodi si formano spesso in piccole cavità all'interno di rocce sedimentarie create da animali antichi o radici degli alberi. Il processo inizia quando l'acqua ricca di minerali scorre nella cavità e viene a contatto con un pezzo di calcare o anidrite. I minerali si induriscono attorno al pezzo di roccia, e il processo ripetuto di mineralizzazione e indurimento forma quello che più tardi diventerà un geode. Nella roccia ignea, i geodi si formano quando la mineralizzazione e l'indurimento si verificano all'interno delle cavità create dalle bolle di gas dall'eruzione originale della lava.
La formazione del cristallo dei geodi richiede molti milioni di anni e dipende da diversi fattori. Per esempio, i tipi di minerali depositati durante la mineralizzazione e la quantità di pressione applicata al geode dalle altre rocce circostanti hanno un grande impatto su come si forma il geode. Quando le condizioni per la formazione del geode sono ottimali, il processo di cristallizzazione avviene nel centro del nodulo e lentamente riempie il geode.