Solitamente gli unici sintomi di una gravidanza chimica sono un test di gravidanza positivo e un periodo mancato. Secondo About.com, molte donne che hanno avuto una gravidanza chimica non sapevano nemmeno di essere incinta.
Una gravidanza chimica è fondamentalmente un aborto molto precoce che avviene intorno alla quarta o quinta settimana dopo l'ultimo ciclo mestruale della donna. L'aborto avviene così presto che la gravidanza non è rilevabile su un'ecografia, anche se è rilevabile con un esame del sangue. Secondo About.com, una volta che la gravidanza è rilevabile con un'ecografia, si passa dalla gravidanza chimica alla gravidanza clinica.