Un vantaggio degli animali geneticamente modificati è che crescono più velocemente e più grandi degli animali naturali e possono produrre in modo più efficiente, secondo il Centro storico animale e legale della Michigan State University. Uno svantaggio di alterare geneticamente gli animali è che diminuisce la diversità genetica della specie, rendendo la specie più vulnerabile a nuovi tipi di malattie infettive.
La possibilità di eliminare i geni dello stress negli animali e renderli non senzienti è uno dei possibili vantaggi degli animali geneticamente ingegnerizzati, osserva la Michigan State University. Ciò rende l'animale incapace di provare dolore e potenzialmente elimina la sofferenza imposta durante una vita industriale. Alcuni potrebbero considerarlo uno svantaggio, in quanto potrebbe rendere le condizioni nelle fabbriche peggiori per gli animali e aumentare la loro sofferenza. I fautori dell'ingegneria genetica considerano anche immorale il furto di un animale della sua sensibilità.
Gli animali geneticamente modificati possono resistere meglio a malattie conosciute come il cancro al seno ereditario, informa la Michigan State University. Ciò consente agli scienziati di ricercare più accuratamente determinate malattie in modo più rapido e meno costoso. Un altro vantaggio è che gli scienziati possono ingegnerizzare geneticamente gli animali per produrre complesse proteine umane, utilizzate per creare nuovi farmaci terapeutici. Questo metodo di produzione di complesse proteine umane è più economico, più facile da produrre e produce in serie e può comportare meno sacrifici di animali rispetto ai metodi tradizionali.
Gli animali geneticamente modificati possono decimare popolazioni selvatiche della stessa specie se gli animali ingegnerizzati fuggono in libertà, afferma la Michigan State University. Possono anche danneggiare l'ambiente naturale.