Il carbonio si trova in tutte le molecole organiche nel corpo umano, che comprende grassi, carboidrati, acidi nucleici e proteine. Il carbonio si trova anche nella CO2 (anidride carbonica), un prodotto di scarto della corpo che viene espirato attraverso i polmoni.
Il carbonio è il secondo elemento più abbondante nella composizione chimica del corpo umano, secondo solo all'ossigeno. Oltre ad essere un elemento fondamentale della maggior parte delle strutture cellulari del corpo, il carbonio è presente nel sangue come anidride carbonica disciolta, acido carbonico e bicarbonati. In questo ruolo, il carbonio è il regolatore del pH corporeo, il sistema cardiovascolare e svolge un ruolo nel corretto funzionamento del sistema digestivo.