Gli effetti collaterali della castrazione umana includono la perdita permanente della funzione sessuale naturale; cambiamenti nell'aspetto fisico, come la perdita di peli sul corpo e l'aumento di peso; cambiamenti negli organi; e effetti psicologici negativi, secondo Medindia. Come trattamento clinico, la castrazione umana viene utilizzata durante alcuni tumori in stadio avanzato.
La procedura è controversa in alcune culture in cui viene usata per punire i trasgressori sessuali, afferma Medindia. Negli Stati Uniti, dal 2015, il Texas consente la castrazione chirurgica per ripetuti autori di reati, e la California e la Florida consentono la castrazione chimica per tali delinquenti, riferisce FindLaw. La castrazione chimica prevede l'iniezione di un condannato per reati sessuali con un farmaco che sopprime il desiderio sessuale, ma i suoi effetti sono completamente reversibili. Questi regolamenti di condanna sono raramente implementati in questi stati.
I medici eseguono anche la castrazione umana per curare tumori dei testicoli o della prostata, una procedura che è molto più comune come trattamento dell'ultimo punto di quest'ultimo, rivela il Globe and Mail. La causa principale degli effetti collaterali fisici della castrazione umana è la drastica riduzione della produzione dell'ormone testosterone nel corpo, la maggior parte dei quali avviene nei testicoli. Poiché il testosterone alimenta la crescita delle cellule tumorali della prostata, la castrazione è un'opzione se altri trattamenti si sono dimostrati inefficaci.