Iberogast è stato sul mercato come integratore per diversi anni e non è stato segnalato che causa gravi effetti collaterali in pazienti medi. Tuttavia, a causa della sua composizione chimica, può causare effetti collaterali in persone con determinate condizioni preesistenti, come quelle che hanno un'allergia all'ambrosia, secondo EMaxHealth.
Le persone allergiche all'ambrosia devono prendere particolare cautela nel prendere Iberogast perché contiene camomilla. Questo può portare a reazioni allergiche comuni come gonfiore della gola o prurito della pelle a seguito di assunzione di rapporti Iberogast, EMaxHealth. Nei casi più estremi, può causare anafilassi, una condizione pericolosa per la vita, che può potenzialmente combinare le reazioni allergiche di gonfiore e prurito con possibili vertigini, svenimenti o un indebolimento dell'impulso, il tutto in pochi minuti di una reazione allergica, secondo alla Mayo Clinic.
Un altro raro insieme di effetti indesiderati è stato riscontrato in Iberogast nei consumatori di integratori che manifestano reazioni avverse alla radice di liquirizia. Un ingrediente importante in Iberogast, la radice di liquirizia è stato segnalato per provocare affaticamento, mal di testa e ipertensione nei soggetti più sensibili ad esso, e in casi particolarmente estremi, può verificarsi un arresto cardiaco, riporta EMaxHealth.