Il più famoso specchio d'acqua di Boliva è il Lago ("Lago" in spagnolo) Titicaca, il più grande lago del Sud America e il più alto lago navigabile commercialmente sulla Terra. Altri laghi nel bacino dell'Altiplano includono Poopó, Salar de Coipasa, Salar de Uyuni e Uru Uru. I laghi del bacino dell'Altiplano vanno dal salmastro al salato. I laghi di acqua dolce nelle pianure comprendono Huaytunas, Rogaguado, Rogagua, Guachuna e El Océano.
Il fiume più notevole in Bolivia è l'Amazzonia. Altri grandi fiumi del bacino amazzonico includono Madiera, Beni, Madre de Dios, Mamoré, Yata, Iténez (noto anche come Guaporé), Itonmas (noto anche come San Miguel, San Julián o San Pablo), Río Blanco (noto anche come Baures o Agua Caliente), San Martin, Rio Grande (noto anche come Guapay) e Acri. Il bacino di La Plata contiene i fiumi Paraguay, Bermejo e Pilcomayo.
Il Sol de Mañana è un geyser nel dipartimento di Potosi della Bolivia sud-occidentale. Lo Stretto di Tiquina è il canale che collega le due metà del Lago Titicaca, il più grande Lago Chicuito e il più piccolo Lago Pequeno.
La Bolivia è senza sbocco sul mare e non si collega al mare in nessuna direzione, sebbene il Lago Titicaca sia abbastanza grande da avere un effetto mitigante sul clima circostante.
