Le principali morfologie del Giappone comprendono montagne, pianure e vulcani. Gran parte del Giappone è costituito da isole - ci sono migliaia di isole che formano il paese. L'isola principale è Honshu, lunga 810 miglia ed è dominata da montagne e vulcani. Shikoku è una delle quattro isole principali, ma è la meno popolata.
Le morfologie montane attraversano la maggior parte del Giappone. Le montagne vantano profonde vallate, pendii alberati e colline. Le profonde vallate si trovano sul lato dell'Oceano Pacifico del paese, mentre le colline sono sull'altro lato, dove si trova il Mar del Giappone. Le montagne hanno diverse altitudini, raggiungendo fino a 9.800 piedi.
L'elevazione più alta in Giappone è il Monte Fuji, che è il principale vulcano dormiente del Giappone. L'altezza del Monte Fuji è di 12.388 piedi, ed è situata a sud-ovest di Tokyo.
Le pianure del Giappone sono situate lungo le aree costiere sia sul lato dell'Oceano Pacifico che sul lato del mare del Giappone. La maggior parte della popolazione in Giappone risiede in queste comunità costiere. Ci sono anche fiumi in campagna in varie località, ma il più lungo è il fiume Shinano. La maggior parte degli altri fiumi sono molto brevi e corrono verso le zone costiere dalle montagne.
