Le principali caratteristiche fisiche del Giappone sono catene montuose, vulcani e foreste pesanti. Il paese vanta poche pianure, che si trovano principalmente lungo la costa, un piccolo numero di laghi e numerosi fiumi brevi.
Circa l'80% del Giappone è montuoso con vulcani attivi e inattivi. Le Alpi giapponesi, che si trovano sull'isola di Honshu, sono montagne enormi che vanno da 8.000 a 10.500 piedi di altezza. La montagna più alta del Giappone si trova vicino a Tokyo. Questo cono vulcanico, chiamato Fujiyama, raggiunge 12,389 piedi di altezza. I vulcani sono una caratteristica importante del Giappone. Ci sono 192 vulcani sulle isole che compongono il Giappone, solo 50 dei quali sono considerati attivi.
Un'altra caratteristica fisica di rilievo è la pianura di Kanto. Sebbene solo il 20 percento del Giappone sia piatto, la pianura di Kanto è grande. È qui che si trova Tokyo. Le poche pianure sono importanti, perché è qui che vive la maggior parte della popolazione e dove si svolgono attività agricole e manifatturiere.
Sebbene ci siano pochi laghi, il più grande è il Lago Biwa. Si trova su Honshu ed è 265 miglia quadrate. Un altro corpo importante d'acqua è il Mare Interno, che si trova tra tre delle isole del Giappone: Shikoku, Kyushu e Honshu. Ci sono molti fiumi in Giappone, ma nessuno può essere navigato in barca. Tuttavia, questi fiumi sono importanti fonti di irrigazione e di energia idroelettrica. Il fiume più lungo è Shinano, e percorre 230 miglia.
