L'unico predatore non umano abbastanza grande da mettere in pericolo una tartaruga marina verde adulta è lo squalo. Tuttavia, i piccoli sono vulnerabili a granchi, gabbiani, squali, pesci e mammiferi. Nonostante siano in pericolo, le tartarughe marine verdi sono anche vulnerabili agli umani che li uccidono per la loro carne, conchiglie e uova.
Le tartarughe marine sono le più vulnerabili quando si sono appena schiuse. Come piccoli, lavorano insieme per scavare sulla superficie della spiaggia e dirigersi verso l'oceano, usando il riflesso della luce lunare sulla superficie dell'acqua per guidarsi. Tuttavia, le luci artificiali possono farli diventare disorientati e andare nella direzione sbagliata, contribuendo a uccidere i bambini e esponendoli a più predatori. Su un centinaio di piccoli, solo uno o due sopravvivono in media il loro primo anno.
Le tartarughe marine sono anche vulnerabili all'inquinamento, allo sviluppo umano e alle malattie che riducono notevolmente la loro popolazione. Alcuni si aggrovigliano nelle reti da pesca commerciali e annegano, mentre altri possono mangiare rifiuti o detriti marini e morire in questo modo. Ogni anno, le tartarughe sono anche ferite in incidenti con eliche di barche. Lo sviluppo costiero elimina i motivi familiari di nidificazione, lasciando le tartarughe verdi femmina senza un posto sicuro dove deporre le uova. Le tartarughe marine verdi sono anche vulnerabili al fibropapilloma, una malattia di origine sconosciuta che causa la crescita dei tumori sui loro tessuti molli.