I fiumi Rio Negro, Jurua e Madeira sono alcuni dei principali affluenti del Rio delle Amazzoni. Esistono più di 17 corpi idrici principali che interagiscono in un modo o nell'altro con il Rio delle Amazzoni.
Il Rio delle Amazzoni si estende per oltre 4.000 miglia e contiene quasi 1.100 affluenti, alcuni molto più piccoli di altri. Il Rio Negro è uno dei più grandi e in termini di flusso d'acqua, detiene il record per il secondo fiume più grande del mondo. In alcuni dei suoi punti più profondi, questo fiume scorre a 300 piedi di profondità, e la foce del fiume si trova a Manaus, in Brasile. Il Jurua e il Madera sono altri affluenti principali e questi sono entrambi più di 2.000 miglia di lunghezza.
Alcuni degli altri grandi tributari dell'Amazzonia sono i fiumi Japura, Purus e Xingu. Tutti questi fiumi sono lunghi almeno 1.000 miglia.
Prima che le moderne strade e altre infrastrutture si sviluppassero, gli affluenti erano i principali passaggi per raggiungere varie aree del Sud America. Questi affluenti hanno anche permesso l'ingresso e l'uscita delle merci nei paesi del continente.
Il bacino del Rio delle Amazzoni vede una media di oltre 7 piedi di pioggia all'anno, tuttavia alcune parti del fiume possono ricevere più di 20 piedi di pioggia durante un periodo di 1 anno.