Numerose specie di funghi possono colpire gli alberi sempreverdi, molti dei quali richiedono i loro metodi unici per il trattamento e il controllo. Alcuni dei più comuni problemi e malattie causati da funghi sempreverdi includono marciume radicale, ruggine, Cancro, malattia dell'ago fuso e ruggine.
I cancri fungini sono uno dei più diffusi tipi di malattie sempreverdi, che sono causati da un'infezione interna di una delle diverse specie di funghi. Questi cancri sono aree di corteccia morta che sono solitamente visibili a causa della resina bianca appiccicosa che fuoriesce da esse. Il fungo provoca la morte della corteccia, che conduce alla zona circostante morendo e perdendo i suoi aghi, comunemente noti come malattia dell'ago fuso. Questa malattia colpisce solo gli alberi che sono stressati da altri fattori ambientali e di solito possono essere trattati aerando e fertilizzando l'area intorno all'albero.
Se l'albero ha un tipo di fungo ruggine o batterico, l'unico metodo efficace di trattamento è spruzzarlo con un fungicida approvato. Se l'albero soffre di un fungo della putrefazione della radice, è probabile che sia collegato a un drenaggio improprio del suolo. In questo caso il fungicida può essere d'aiuto, ma prima è necessario risolvere il problema dell'acqua in eccesso per evitare che l'infezione ritorni.