Le prime 10 malattie trasmissibili nelle Filippine, basate sui dati dell'Organizzazione mondiale della sanità, comprendono tubercolosi, febbre dengue, polmonite, malaria, diarrea, bronchite, influenza, malattie febbrili acute, HIV e infezioni del tratto respiratorio inferiore. Otto delle prime 10 cause di morbilità nelle Filippine erano malattie trasmissibili.
Storicamente, l'HIV, la malaria e la tubercolosi hanno causato il maggior numero di morti tra le malattie trasmissibili. Si stima che la tubercolosi rappresenti il 9% di tutti gli anni di vita persi nel paese. Ufficialmente, le Filippine sono elencate come un paese a basso rischio per l'HIV, con meno dell'uno per cento della popolazione sieropositiva. Anche i casi di malaria sono diminuiti negli ultimi anni.