La causa più comune di acqua di pozzo marrone è la contaminazione da ferro. Un improvviso cambiamento nel colore dell'acqua significa che il contaminante è stato recentemente introdotto nel pozzo e potrebbe essere causato da contaminazione industriale, tubature arrugginite infissi o lisciviazione di ferro naturale da terra.
Il trattamento chimico e la filtrazione dei sedimenti sono usati per rimuovere il ferro dall'acqua di pozzo. Dopo che il ferro è stato rimosso, l'acqua richiede un ulteriore trattamento chimico per uccidere i batteri che consumano ferro che possono aver formato un biofilm nell'acqua del pozzo. Se il ferro rimane nell'acqua di pozzo, i batteri possono ritornare e causare problemi a ripresentarsi.
