Le principali morfologie del Pakistan includono il Khyber Pass, il Bolan Pass, il Balochistan Plateau, la pianura dell'Indo, l'Hindu Kush, la catena del Karakorum e le montagne dell'Himalaya. La più alta elevazione in Pakistan si trova nel picco Himalayan Mountain K2, che sorge a 28.269 piedi sopra il livello del mare.
Altre aree montuose in Pakistan includono la Safed Koh Range, la Sulaiman Range e la Kirthar Range, tutte situate in una parte del paese conosciuta come gli altopiani settentrionali. I passaggi tra queste montagne che attraversano il confine tra Pakistan e Afghanistan limitrofo includono il passo di Khojak e il passo di Broghol più a nord. L'area della pianura dell'Indo, che è caratterizzata come la regione interessata dal fiume Indo, comprende sia i bacini del fiume Indo superiore e inferiore. L'altopiano di Potwar contiene le altitudini più elevate nella pianura dell'Indo e conduce ai piedi della catena montuosa dell'Himalaya. Il deserto della Valle dell'Indo si trova anche nelle pianure dell'Indo. La pianura del Punjab è l'area tra il fiume Indo e il confine con l'India. L'altopiano del Belucistan si trova nel sud-ovest del paese e conduce al confine con l'Iran. Il deserto Kharan si trova nel sud-ovest del paese. Il Pakistan comprende sia le placche tettoniche eurasiatica che quella indiana.
