La profondità media dell'oceano è 2.65 miglia, che equivale a circa 14.000 piedi. L'area più profonda conosciuta dell'oceano, Challenger Deep nella Fossa delle Marianne, è profonda 36.200 piedi, a 6,86 miglia dal superficie.
L'oceano è tipicamente diviso in zone in base alla profondità. La zona afosa, o senza luce, dell'oceano varia con la torbidità dell'acqua e la stagione, ma generalmente inizia da 660 a 3300 piedi dalla superficie. La zona fotica, che termina con la zona pelagica, è l'area più alta dell'oceano. Al di sotto della zona pelagica si trova l'area bentonica, che comprende le zone batiale, abissale e abituale. La zona bentonica inizia a meno di mezzo miglio dalla superficie e si estende fino alle zone più profonde della fossa.
