Le lontre marine si proteggono dai predatori scappando verso la terraferma, nascondendosi nelle alghe o nuotando lontano. I principali predatori delle lontre marine sono gli squali e le orche acquatiche, quindi le lontre marine possono proteggersi salendo sulla terra.
Sebbene le lontre marine debbano proteggersi più spesso dai predatori marini, devono anche fare attenzione ai predatori della terra. I coyote e gli orsi sono noti predatori della terra delle lontre marine. Se le lontre non possono scappare in acqua da questi predatori, devono usare i loro denti forti come ultimo sforzo.
Le lontre marine non hanno solo bisogno di protezione dai predatori, ma dal loro stesso ambiente. La loro inclinazione naturale è quella di trascorrere una grande quantità di tempo in acqua fredda. Mentre alcuni mammiferi marini usano uno spesso strato di grasso per scaldarsi, le lontre si isolano con uno spesso strato di pelliccia. Ogni centimetro quadrato di pelle di una lontra è coperto da circa un milione di peli. Questo pelo denso impedisce all'acqua di raggiungere la pelle e agisce come un cappotto impermeabile.
Anche le lontre marine sono al corrente del bracconaggio e delle malattie. Ad esempio, a metà degli anni '90, una malattia minacciava di desolazione della popolazione della lontra di mare della California. Anche il bracconaggio per la pelliccia degli animali ha gravemente colpito la popolazione delle lontre marine.