Secondo Jennifer Welsh per Live Science, le amebe sono generalmente considerate come riproducenti asessualmente attraverso un processo chiamato fissione binaria. Questo descrive l'atto in cui il nucleo di una cellula viene stimolato a dividersi in un uguale e replica esatta di se stessa all'interno delle stesse pareti cellulari, dopo di che i due nuclei si separano nelle loro singole cellule, risultando in due amebe sovrane e geneticamente identiche.
Dave Mosher per Scientific American afferma che gli scienziati moderni hanno recentemente iniziato a chiedersi se le amebe siano in realtà puramente asessuose o se il comportamento riproduttivo che gli scienziati hanno studiato in passato sia semplicemente il risultato di condizioni di laboratorio controllate. Gli scienziati credono che tutta la vita animale scaturisca dall'evoluzione di organismi unicellulari come le amebe. La maggior parte degli animali si riproduce sessualmente attraverso l'atto di inseminazione embrionale tradizionale maschile e femminile. Pertanto, Mosher afferma che ad un certo punto della storia evolutiva della vita animale, le amebe devono aver iniziato a riprodursi sessualmente. Il comportamento sessuale tra le amebe non è mai stato osservato. Se la teoria è accurata, non indicherebbe che le amebe si riproducono necessariamente con l'uso di organi sessuali tipici, ma invece indurranno gli scienziati a ridefinire le ipotesi di base su quali comportamenti potrebbero definire l'atto sessuale.
La riproduzione asessuata è immediatamente vantaggiosa perché è veloce come un'ameba può essenzialmente fare una copia di se stessa a piacimento; tuttavia, questa forma di riproduzione alla fine porta all'estinzione. Gli errori si accumulano nel genoma nel tempo; se ogni individuo nella popolazione è una copia esatta degli altri, alla fine tutti vengono contaminati da mutazioni fatali. La riproduzione sessuale crea diversità genetiche, riducendo la possibilità di mutazioni dannose in ogni individuo. Le amebe sono in grado di riprodursi in entrambi i modi, a seconda delle variabili ambientali.