L'American Society for Microbiology non ha ancora trovato un archaebacteria che causa malattie o è dannoso per il corpo umano. Mentre questi microrganismi hanno molte caratteristiche di altri batteri che causano malattie, la loro conoscenza è limitata.
I metanogeni sono una varietà di archeologia che è stata trovata nel corpo umano. Ci sono domande sul fatto che siano dannose o benefiche. La difficoltà di isolare e coltivare questi batteri è parte della ragione per cui si può dimostrare così poco di loro. È noto che sopravviveranno e cresceranno solo in un ambiente anaerobico. Sono tra le forme di vita più abbondanti sul pianeta.