La cromatografia è utilizzata nei processi industriali per purificare le sostanze chimiche, testare tracce di sostanze, composti chirali separati e prodotti di test per il controllo di qualità. La cromatografia è il processo fisico mediante il quale le miscele complesse vengono separate o analizzate . Questo viene fatto sciacquando sostanze diverse a velocità diverse in base all'assorbimento su diversi media.
La cromatografia separa e analizza gli additivi, le vitamine, i conservanti, gli amminoacidi e le proteine negli alimenti per determinare il contenuto nutrizionale. La cromatografia è in grado di rilevare l'aflatossina, un cancerogeno trovato nella muffa che cresce sulle noccioline.
Un uso a largo raggio della cromatografia è rilevare la presenza di alcol nel sangue. Il processo inoltre filtra i farmaci nelle urine e in altri fluidi corporei. In termini di scienza forense, la cromatografia può rilevare tracce di sostanze chimiche in acceleranti o esplosivi.
L'industria farmaceutica ha trovato il modo di separare i composti chirali usando la cromatografia, come descrive l'Enciclopedia della Scienza. La talidomide è un esempio di composto chirale con due isomeri identici in tutti i sensi tranne l'allineamento delle molecole. Un isomero causa difetti alla nascita e l'altro potrebbe essere usato per trattare i batteri resistenti ai farmaci. La separazione dei due isomeri di questo composto mediante la cromatografia è di vitale importanza per mantenere il buon talidomide dalla contaminazione della versione errata.
La gascromatografia è uno dei processi chimici più comunemente usati per separare liquidi, solidi e gas. Secondo il gruppo Linde, il processo funziona inserendo una miscela in una corrente di gas inerte. Le diverse sostanze sono separate per dimensione, interazione con altri media e assorbimento in rivelatori chimici.