I pipistrelli vivono in regioni di sei continenti del mondo in foreste, deserti, aree urbane, grotte e persino case di pipistrelli costruite da persone. A causa della loro capacità di adattamento, non c'è praticamente alcun limite al luogo in cui un pipistrello può vivere.
Esistono più di 1.300 specie di pipistrelli che vivono in diversi climi ed ecosistemi in tutto il mondo. Abitano in piccoli spazi come crepe nelle rocce o alberi e possono anche essere visti in aree aperte vicino all'acqua fresca e costiera. Inoltre, i pipistrelli vivono a diverse altezze, tra cui le Ande peruviane e il livello del mare, come in molte delle isole del sud-est asiatico. Sebbene gli habitat dei pipistrelli siano vasti, non si trovano nel Polo Nord o nel Polo Sud.