La fermentazione sommersa è un metodo di produzione di biomolecole in cui enzimi e altri composti reattivi sono immersi in un liquido come alcool, olio o un brodo nutriente. Il processo viene utilizzato per una varietà di scopi, principalmente nella produzione industriale.
La fermentazione sommersa avviene in vasche di grandi dimensioni riempite di liquido e poi seminate con microrganismi che attivano il processo di fermentazione. La fermentazione richiede solitamente parecchi giorni per completare e un flusso costante di ossigeno deve circolare per tutto il tempo attraverso i carri armati. Altre variabili che influenzano la fermentazione sommersa includono il livello di pH del liquido, la temperatura e la forza ionica.