Cilia e flagelli sono entrambe strutture simili ai capelli utilizzate per il movimento delle cellule eucariotiche. Sia le ciglia che i flagelli si possono trovare nelle cellule vegetali e negli spermatozoi dei mammiferi.
Cilia e flagelli sono organelli che rivestono la superficie delle cellule eucariotiche. Queste protuberanze simili a peli si muovono in onde, favorendo il movimento della cellula. Sono strutturalmente simili, ma le ciglia sono più corte e spesso più numerose dei flagelli. Entrambi sono formati da microtubuli che scorrono uno contro l'altro, creando il movimento che genera il movimento cellulare. Oltre alle cellule in movimento, le ciglia aiutano anche il movimento dei liquidi, più comunemente nel sistema riproduttivo femminile.