I vacuoli contrattili nei protisti raccolgono i prodotti di rifiuto accumulati e l'acqua in eccesso all'interno della cellula. espellono questi rifiuti nell'ambiente attaccandosi alla parete cellulare, quindi contraendosi per rilasciare questi prodotti all'esterno della cellula .
I vacuoli contrattili in protista sono importanti per la vita dell'organismo. Come organismi unicellulari, i protisti sono suscettibili di cambiamenti nella pressione osmotica, ampie variazioni di temperatura e pH e esposizione a diverse sostanze chimiche nei loro dintorni. Vacuoli contrattili regolano il contenuto della cellula, la pressione osmotica e l'ambiente interno espellendo materiale inutile o addirittura deleteria per la sopravvivenza dell'organismo.