Le pipistrelli si chiamano cuccioli e acquisiscono la loro alimentazione nutrendosi del latte della madre. Baby bats infermiera dal momento in cui sono nati fino a circa sei mesi di età.
Mentre molte persone trovano i pipistrelli poco attraenti o addirittura spaventosi, queste creature hanno notevoli capacità. La mazza femminile ha la straordinaria capacità di ritardare la sua fecondazione o l'impianto di uova in base alla quantità di cibo disponibile nell'ambiente e ad altri fattori che possono danneggiare la sua gravidanza. Dopo aver acquisito lo sperma maschile, può conservarla fino a quando si sveglia dal letargo in primavera e può scegliere di partorire durante la tarda primavera o all'inizio dell'estate. Alcune specie, tra cui il famoso pipistrello della frutta, possono sincronizzare le nascite collettivamente. Anche con questo alto livello di autocontrollo, la maggior parte delle specie dà alla luce un bambino alla volta in una data stagione. I pipistrelli sono molto attaccati alla loro prole e possono riconoscere i propri rispetto agli altri per differenze nel suono e nel profumo. La madre pipistrello si allatterà e proteggerà la sua giovane mentre è vulnerabile; manca le ali sviluppate quando nasce e nel complesso non può prendersi cura di se stessa. In genere occorrono sei mesi affinché il pipistrello raggiunga la piena maturità e indipendenza, sebbene l'età della maturità possa variare a seconda delle specie.