Il calcare deriva dall'accumulo di detriti organici di gusci, materia fecale, alghe e coralli o da carbonato di calcio disciolto che si deposita sul fondo marino. È costituito principalmente da carbonato di calcio sotto forma di minerale, calcite. Il calcare si forma generalmente in ambienti marini chiari, caldi e poco profondi.
Il calcare a volte si forma in acqua dolce e si forma anche nelle caverne per evaporazione. Quando l'acqua evapora, qualsiasi carbonato di calcio disciolto in esso viene depositato nel sito. Se l'acqua evapora sul soffitto di una grotta, forma gradualmente delle stalattiti, mentre forma delle stalagmiti se cade prima a terra.