I tre tipi di archaebacteria utilizzano ciascuno un diverso tipo di metodo per creare ATP, che includono la conversione di metano nell'ATP da parte dei metanogeni, l'uso della respirazione aerobica o la conversione di energia luminosa da alofili e teromofili che convertono l'idrogeno solforato per creare ATP. Questi tipi di batteri sono tenuti in una classe da soli a causa delle condizioni che spesso popolano. Gli archeobatteri sono i più antichi organismi viventi conosciuti al mondo.
I metanogeni sono unici nel fatto che non possono esistere in ambienti ossigenati. Questi batteri si trovano principalmente in aree come paludi, fognature e persino intestino. I batteri comuni non possono sopravvivere in aree con alto contenuto di sale, ma nella classificazione degli archeobatteri vi è un'eccezione. Gli alofili prosperano in alti ambienti salati come il Mar Morto oi Grandi Laghi Salati. Gli alofili a differenza degli altri tipi di archeologia possono cambiare il tipo di processo di creazione di energia che usano dalla respirazione aerobica alla fotosintesi con un pigmento chiamato batteriorodopsina. I termofili vivono in aree ad elevata acidità e calore. Possono sopravvivere a temperature fino a 230 gradi Fahrenheit, il che rende le prese d'aria vulcaniche e le prese d'aria idrotermiche aree ideali per farle prosperare. Le loro forme possono resistere a pH fino a 2. Questi tipi di batteri, nonostante la loro unicità, sono classificati come prokryates.