Sebbene il calcare non influenzi l'ambiente, l'estrazione di calcare può avere un impatto negativo. D'altra parte, l'ambiente può influenzare il calcare scomposizione.
L'estrazione di calcare può inquinare l'acqua e creare doline. Quando il calcare si dissolve mentre è ancora nel terreno, si formano caverne e gole, un fenomeno naturale noto come carsico. Sebbene ciò non danneggi l'ambiente nella sua forma naturale, una volta estratto il calcare, le doline possono formare e interrompere i corsi d'acqua sotterranei. Questo cambia la falda naturale. L'attuale processo di estrazione mineraria modifica anche i corsi d'acqua esistenti, aggiungendo ulteriore acqua a corsi d'acqua e altri corpi idrici che non solo inondano l'area circostante, ma aggiungono anche sostanze inquinanti. Allo stesso tempo, attinge l'acqua da altre caratteristiche come laghi e stagni.
Il calcare può essere danneggiato dall'ambiente attraverso il tempo e l'erosione dell'acqua. La pietra assorbe l'acqua che può causarne il deterioramento nel tempo. Se l'acqua ha un alto contenuto di acidità, il danno è più immediato. Il vento può consumare dettagli in pietra. Il calcare è anche soggetto a decolorazione mediante esposizione a olio, coloranti o materiale organico, come escrementi di uccelli o sostanze vegetali in decomposizione. Può anche ottenere macchie di ruggine se esposto a ferro ossidante.