Gli effetti delle piogge acide sulla crescita delle piante variano a seconda dei terreni locali e di altri fattori, ma è generalmente negativo, inibendo la crescita delle piante o persino uccidendo le piante esistenti. La scala dell'effetto dell'acido la pioggia dipende sia dalla sua quantità sia dalla presenza di componenti del terreno di tamponamento.
La pioggia acida di solito non uccide direttamente le piante, anche se indebolisce le foglie di molte piante. Invece, tende a influenzare le piante limitando i nutrienti che ottengono o rilasciando le tossine dal suolo. Solo queste causano una crescita più lenta delle piante, ma se combinate con altri stress ambientali, possono portare alla morte. Le foreste soggette a pioggia acida sono state osservate con brunitura e perdita prematura delle foglie. Intere macchie di foresta vengono perse con la pioggia acida come fattore che contribuisce.
La pioggia acida ha una maggiore capacità di sciogliere alcuni nutrienti del suolo rispetto alla normale pioggia, quindi può facilmente eliminare questi nutrienti dal terreno. Allo stesso tempo, possono anche dissolvere sostanze tossiche, come l'alluminio, e esporre loro le radici delle piante. Alcuni terreni hanno particelle di calcare o altre sostanze che neutralizzano l'acidità della pioggia. Anche in alcuni di questi casi, grandi quantità di pioggia acida o nebbia acida possono superare le protezioni.