I microscopi sono utilizzati in una varietà di campi per visualizzare oggetti o organismi che non sono visibili ad occhio nudo. Questi dispositivi sono utili in biologia e medicina per studiare o analizzare campioni, come batteri, cellule e tessuti corporei. Alcuni altri usi dei microscopi includono per indagini sulla scena del crimine, campioni di minerali e materiali chimici.
Nelle scene del crimine, gli scienziati forensi raccolgono prove, come ad esempio casi di proiettili, per esaminare sotto un microscopio di confronto. In geologia, i campioni di minerali e rocce possono essere studiati al microscopio per studiare la loro composizione. In chimica, materiali diversi, come metalli e struttura atomica degli elementi.
Esistono diversi tipi di microscopi utilizzati nella scienza, compresi i microscopi elettronici a scansione, di dissezione, elettronici a scansione e a trasmissione. Le immagini possono essere due o tridimensionali a seconda dei microscopi. Allo stesso modo, l'ingrandimento varia con diversi microscopi. Ad esempio, il microscopio elettronico a trasmissione presenta immagini in 2-D e ha sia un alto ingrandimento sia una risoluzione.