Ci sono molte teorie relative al motivo per cui gli Anasazi sono scomparsi, ma non ci sono prove solide che diano una ragione specifica. In precedenza si sospettava che la siccità alla fine del 1200 li allontanasse dalle loro case di lunga data ma altre scoperte hanno dimostrato che questo non sarebbe stato sufficiente da solo a scacciarlo.
Anche l'idea che queste persone siano completamente scomparse è un termine improprio. I moderni indiani Pueblo sono discendenti diretti di questa razza di persone, quindi non sono mai veramente scomparsi. Le prove dimostrano che l'Anasazi potrebbe aver scelto di partire per essere stato impantanato nella zona per troppo tempo e che la terra è stata utilizzata fino ai suoi limiti.
