Ci sono alcune malattie che fanno diventare le piante di basilico marroni, come la peronospora, l'appassimento del fusarium e la macchia batterica delle foglie. Queste malattie causano macchie e strisce marroni sulla pianta, incluso il foglie e steli.
Una delle malattie più gravi per le piante di basilico è la peronospora, che è causata da una malattia fungina. Le foglie diventano marroni o grigie, a cominciare dall'ingiallimento della foglia superiore sulla pianta. Successivamente, le parti inferiori delle foglie diventano viola o grigie perché è lì che si propagano le spore fungine. Alla fine le foglie diventano marroni e muoiono. Quei giardinieri che lo prendono in anticipo possono rimuovere le foglie malate, ma devono fare attenzione perché se le spore vengono buttate giù, possono diffondersi.
Un'altra malattia che causa l'inizio di una pianta di basilico che diventa marrone è l'appassimento del fusarium, che è una muffa causata da un'infezione fungina. Questo stampo di solito infetta le piante perché è nel terreno. Fa appassire le foglie, ingiallisce e cade, e gli steli si attorcigliano, si rastremano e ottengono macchie o strisce marroni.
La terza malattia che causa le piante di basilico marrone è la macchia batterica delle foglie, causata dai batteri Pseudomonas cichorii. Questa malattia viene anche trasportata nel terreno e trasforma le foglie e gli steli marroni.