Il clima della zona intertidale dipende dal clima della regione circostante. Ad esempio, il clima della zona intertidale lungo la costa dell'Antartide è ghiacciato e instabile, mentre il clima del clima la zona intertidale di un'isola tropicale è calda e stabile.
Poiché l'acqua della zona intertidale è così poco profonda, è soggetta a modifiche in base alle condizioni meteorologiche dell'aria sopra. Nelle regioni in cui le condizioni meteorologiche cambiano frequentemente, le zone intercotidali possono mancare di biodiversità, poiché molti organismi acquatici non sono in grado di adattarsi al clima instabile. Un'altra barriera alla biodiversità è l'alto contenuto di sale di molte zone intercotidali.