Il concetto di specie morfologica raggruppa le specie secondo somiglianze morfologiche e ignora altre differenze come il DNA o l'incapacità di riprodursi tra individui. Il concetto di specie morfologiche deriva dalla morfologia, che è lo studio del fisico aspetti di un organismo e la loro disposizione.
La morfologia è essenzialmente lo studio della struttura delle parti degli organismi. I morfologi si concentrano sulla comprensione della disposizione delle parti, comprese le caratteristiche fisiche esterne, nonché gli organi interni, i sistemi e le strutture ossee. A differenza della fisiologia, che si concentra sulla funzione delle parti di un organismo, la morfologia cerca solo di capire e classificare le parti e la loro disposizione in vari organismi. Una specie morfologica è classificata in base unicamente alla morfologia o alla struttura. Secondo il concetto di specie morfologiche, un morfologo userebbe la dimensione, la forma, il colore e la struttura di un organismo e lo confronterebbe con un altro per determinarne la specie. Mentre è vero che la variazione tra organismi strettamente correlati è inferiore a quella tra organismi lontanamente imparentati, il concetto di specie morfologica ignora alcuni aspetti importanti dello sviluppo dell'organismo utilizzato per classificare le specie. Alcune specie sono strutturalmente simili, ma sono creature geneticamente distinte. Queste creature sono indicate come specie criptiche. Seguendo solo il concetto di specie morfologiche, queste creature sarebbero classificate come un'unica specie nonostante le grandi differenze genetiche. Tuttavia, quasi tutti gli scienziati utilizzano una certa morfologia nella classificazione e nella distinzione delle specie in quanto forma fisica e struttura sono componenti chiave della comprensione degli organismi.