I virus sono identificati scientificamente in modo simile agli organismi; sono indicati con il nome del genere e della specie. Al di sopra di questi, due sistemi di classificazione, complementari a ciascuno, creano una tassonomia per i virus.
Il Comitato internazionale sulla tassonomia dei virus organizza virus a uno dei sette ordini, che contengono famiglie e sottofamiglie prima delle denominazioni di genere e di specie. I virus sono difficili da classificare al di sopra della tassonomia di un ordine, in quanto hanno genomi relativamente piccoli e un alto tasso di mutazione. Il sistema di classificazione di Baltimora, definito per la prima volta nel 1971, separa i virus in sette gruppi in base alla loro combinazione di acido nucleico in DNA o RNA, indipendentemente dal fatto che siano a singolo o doppio filamento, metodo di replicazione e polarità dell'acido nucleico in positivo o negativo .