I giaguari vivono in una varietà di habitat naturali, tra cui foreste pluviali, praterie e aree montuose. Ai giaguari piace fare le loro tane in luoghi con terreno più morbido e preferire le fitte foreste pluviali; tuttavia, possono essere trovati a costruire le loro case in paludi, sotto cenge rocciose o vicino a corsi d'acqua.
Il giaguaro una volta andava dal Sud America fino agli Stati Uniti sudoccidentali. Tuttavia, attualmente vive principalmente in Sud America e in alcune parti dell'America centrale. Inoltre è considerato in pericolo in ogni parte della sua gamma. Le piccole popolazioni di giaguari rimangono negli Stati Uniti a partire dagli anni 2000. Una possibile popolazione riproduttiva vive a sud di Tucson, in Arizona, mentre un'altra si aggira per la ruota del Nuovo Messico.
Il giaguaro ama vivere con l'acqua e spesso caccia animali che vivono nell'acqua come pesci, tartarughe e caimani. Salta spesso nei fiumi all'inseguimento della preda. Il giaguaro caccia un'ampia varietà di prede da cervo a scimmie, capibara, tapiri, uccelli e persino bestiame. È noto per essere un predatore stalking piuttosto che uno che lo insegue.
Il mantello maculato del giaguaro aiuta a camuffarlo nelle foreste dove la luce del sole filtra attraverso gli alberi, mentre scompone il contorno dell'animale. Di conseguenza, è un predatore molto efficace.