Il trattamento per E. Coli nei cani comporta generalmente iniezioni per ripristinare i fluidi corporei, somministrazione di una soluzione di glucosio per il trattamento della diarrea e antibiotici, secondo PetMD. La maggior parte dei cani che contraggono E. coli necessiteranno essere ricoverato in ospedale e sottoposto a un trattamento di emergenza; poiché un cucciolo appena nato ha un sistema immunitario non sviluppato, il trattamento generalmente non ha successo nei cani di questa età.
Dopo il trattamento per E. coli nei cani adulti, è necessario svolgere attività limitata, monitoraggio, calore e riposo in gabbia durante il periodo di recupero, come affermato da PetMD. Può essere necessario somministrare biberon o liquidi per via endovenosa per garantire che il cane interessato riceva adeguati bisogni nutrizionali. Mentre il cane recupera, un veterinario può campionare il sangue del cane per determinare lo stato di infezione del cane. Una volta a casa, il cane dovrà essere sorvegliato per eventuali sintomi di battuta d'arresto e la sua temperatura corporea dovrà essere monitorata. L'ulteriore trattamento dipende in gran parte dai progressi del cane.
Per i cuccioli, il modo più importante per prevenire l'E. coli è quello di assicurarsi che nutrano e ricevano il colostro prodotto dal cane madre nel suo primo latte dopo la nascita. Altrettanto importante è cambiare la biancheria da letto per la lettiera, così come lavarsi le mani prima di maneggiare i cuccioli appena nati che stanno ancora sviluppando il loro sistema immunitario.