La differenza tra anafase 1 e anafase 2 è la separazione di diversi tipi di cromosomi. Nell'anfase 1 della mitosi, i cromosomi omologhi (uguali) si separano da entrambi i lati della cellula, e il centromero è intero In Anaphase 2, i cromatidi fratelli si separano e il centromero è diviso, il che causa la separazione dei cromatidi.
Nell'anfase 1, i cromosomi omologhi si spostano ai poli opposti e i cromatidi fratelli rimangono attaccati. Ci sono altri cambiamenti: i microtubuli cinetocore (fusi) si accorciano per tirare i cromosomi verso i poli. Questo forma due insiemi aploidi che significano che ogni set ha 23 cromosomi o 46 totali, il numero che si trova tipicamente negli umani. Ogni cromosoma ha due cromatidi che si muovono separatamente nell'anfase 2.
In anafase 2, i centromeri sono scissi al centro permettendo ai microtubuli di attaccarsi ai cinetocori che separano i cromatidi fratelli. I centromeri sono la parte centrale dei cromatidi fratelli che li tengono uniti, spesso rappresentati da un punto o da un cerchio. Quando questo è rotto, i due separati. I cromatidi fratelli sono ora chiamati gemelli cromosomi mentre si muovono verso i poli opposti e non sono più insieme. A questo punto, la cellula è quasi pronta per separarsi completamente in cellule figlie, risultando in quattro cellule figlie complessive entro la fine della meiosi 2.
