Una molecola è un gruppo di due o più atomi legati insieme, mentre un composto è un gruppo di due o più atomi legati insieme dove gli atomi provengono da almeno due tipi di elementi. Tutti i composti sono anche molecole, ma tutte le molecole non sono composti.
Ad esempio, la formula H2O è sia una molecola che un composto, ma l'H2 è solo una molecola poiché contiene solo atomi di idrogeno. Nella chimica inorganica, il termine molecola è tipicamente limitato ai composti con carica neutra, mentre il termine ione si riferisce agli atomi legati con una carica positiva o negativa.
