La geometria molecolare di IF5, nota anche come pentafluoruro di iodio, è una piramide con una base quadrata che circonda un atomo di iodio centrale. Ciascuno degli angoli della piramide è un atomo di fluoro.
L'angolo tra ciascuno dei legami nella molecola è di 90 gradi per i quattro atomi di fluoro che costituiscono la base della piramide e di 180 gradi per il singolo atomo di fluoro che costituisce il punto della piramide. La struttura bidimensionale del pentafluoruro di iodio è scritta come un atomo di iodio centrale circondato da cinque atomi di fluoruro in una forma a stella simile a un asterisco, ma questo è per comodità e non corrisponde alla vera forma della molecola o agli angoli di legame coinvolti .
Il pentafluoruro di bromo ha una forma molto simile al pentafluoruro di iodio.