La parte più profonda del bacino dell'Oceano Atlantico è la Fossa di Porto Rico, che corre ad est dalla costa settentrionale di Hispaniola fino ad un punto oltre le Piccole Antille. Questa trincea raggiunge una profondità massima di 28.374 piedi , che è di circa 8.000 piedi meno profonda della Fossa delle Marianne del Pacifico.
La trincea di Puerto Rico si è formata lungo il confine tra la placca caraibica e la placca nordamericana. La subduzione molto piccola si verifica in corrispondenza della faglia di trasformazione tra queste piastre e la maggior parte del movimento è laterale. Questo riduce l'attività vulcanica nell'area, ma aumenta notevolmente il rischio di terremoti.