La profondità di compensazione è il livello al quale l'acqua di mare dissolve la calcite o il carbonato di calcio. Vicino alla superficie dell'oceano, dove l'acqua è calda ea bassa pressione, le specie planctoniche sono libere di incorporare calcio e carbonio nei loro gusci mineralizzati. Tuttavia, a profondità di compensazione, l'acqua fredda e acida scioglie rapidamente il carbonato di calcio.
La profondità di compensazione è il punto in cui l'acqua scioglie completamente il carbonato di calcio e liscivia il minerale dai sedimenti del fondale marino. La lisoclina, come viene talvolta chiamata, è in media da 4 a 5 chilometri in profondità nella maggior parte delle aree, sebbene goccioli più in profondità dove il deflusso continentale causa turbolenza e suscita tutti tranne gli strati più profondi dell'oceano. Nei luoghi in cui la turbolenza interessa gli strati oceanici, la profondità di compensazione è solitamente superiore alla media.
L'acidità delle acque profonde deriva da un accumulo di CO2 rilasciato da specie di animali in acque profonde. Questi animali estraggono ossigeno dall'acqua circostante ed espellono CO2 allo stesso modo degli altri animali. A profondità, tuttavia, la CO2 non può sfuggire alle alte pressioni e alle temperature estremamente fredde dell'acqua in cui è sospesa. Ciò rende l'acqua notevolmente più acida rispetto alle acque superficiali e fa sì che dissolva il calcio che viene depositato dalla costante pioggia del plancton scaduto dall'alto . Poiché l'acqua profonda estrae la calcite dalle rocce, il calcare non può formarsi in profondità. Questa differenza aiuta i geologi a determinare la profondità alla quale alcune rocce si sono formate sugli antichi fondali marini.
