Le armi utilizzate durante l'attacco a Pearl Harbor includevano bombe, siluri, mitragliatrici e cannoni antiaerei. Le bombe e i siluri giapponesi vennero lanciati da numerosi aerei, compresi i bombardieri B5N2 e i bombardieri Aichi D3A1. I giapponesi hanno anche utilizzato gli Zeri modello 21 A6M per confondere le basi aeree attorno a Pearl Harbor.
I bombardieri B5N2 più grandi portavano ciascuno un singolo siluro Tipo 91 modello 2. Questi siluri erano dotati di alette di legno attorno alle eliche, che li aiutavano a operare nelle acque poco profonde del porto. Ogni siluro pesava circa 1.847 sterline e aveva una testata da 452 libbre. Il bombardiere B5N2 aveva anche una mitragliatrice calibro 30 situata nella coda dell'aereo, che i cannonieri usavano per mitragliare bersagli mentre l'attentatore passava sopra la testa.
Degli 89 bombardieri della prima ondata, 40 di essi trasportavano siluri Tipo 91 Modello 2. Gli altri 49 bombardieri trasportavano bombe di Tipo 5 del Tipo 91 che pesavano 1,763 libbre. La bomba del modello 5 ha avuto la capacità di perforare attraverso più ponti della nave bersaglio quando è caduta da un'altitudine elevata.
I più piccoli bombardieri Aichi D3A1 portavano ciascuno una singola bomba terrestre tipo 98 che pesava 551 libbre. Queste bombe sono state designate specificamente per l'uso quando si attaccano le piste di atterraggio e le basi aeree intorno a Pearl Harbor. Dopo che i bombardieri in picchiata avevano sganciato le loro bombe, si unirono agli Zeri del modello 21 dell'A6M per mitragliare i bersagli a terra con le mitragliatrici e i cannoni da 20 millimetri.
