Linnaeus basava il suo primo sistema di classificazione sugli organi riproduttivi delle piante, secondo una storia di Carl Linnaeus sul sito web del Museo di Paleontologia dell'Università della California. La classe e l'ordine di una pianta furono decisi dai suoi stami (organi maschili) e dai suoi pistilli (organi femminili). Le piante senza un evidente orientamento sessuale erano raggruppate nella classe Cryptogamia, altrimenti nota come "piante con un matrimonio nascosto".
Alla fine Linneo sviluppò un sistema che categorizzava le cose viventi e inanimate in modo gerarchico, secondo il Portale della Pubblica Istruzione. Il suo sistema passò dalla categoria più ampia alla più specifica in ordine decrescente. Studiando morfologia, l'aspetto di una creatura, Linneo ha classificato più di 11.000 organismi. Mentre la scienza moderna utilizza la filogenetica (relazioni evolutive) come base per l'organizzazione, il lavoro di Linneo è ancora considerato il fondamento della tassonomia.
La teoria dell'evoluzione di Charles Darwin cambiò il modo in cui gli scienziati classificarono le creature viventi. Mentre i biologi sono d'accordo con Linneo nel mettere suini, porcospini e persone nel genere Mammalia, lo fanno per diversi motivi, secondo Understanding Evolution del Museo di Paleontologia dell'Università della California. Mentre Linneo cercava di raggruppare le specie per apparenza, i moderni tassonomisti seguono la teoria evolutiva secondo cui le tre specie avevano tutte quattro zampe e nutrivano i loro piccoli perché discendevano da un antenato comune.