Una bassa conta piastrinica può essere causata da molte infezioni batteriche, virali, fungine e parassitarie, inclusa l'ehrlichiosi, una malattia trasmessa dalle zecche. Il virus del cimurro canino è un'altra causa comune di bassa conta piastrinica.
La conta piastrinica bassa è solitamente causata da una condizione chiamata trombocitopenia immuno-mediata o IMT. È una malattia autoimmune, il che significa che il sistema immunitario attacca le proprie piastrine. Occasionalmente può verificarsi senza ragioni ovvie ed è anche collegato a malattie non infettive come il cancro o come reazione a determinati farmaci. Vi sono casi occasionali di basso numero di piastrine non causati dall'IMT, ma questi sono rari e solitamente correlati a malattie del midollo osseo. Alcune razze, tra cui i Grandi Pirenei, possono avere un numero di piastrine basso a causa di problemi congeniti.
Le malattie trasmesse da zecche sono una delle cause più comuni di IMT. Oltre all'ehrlichiosi, i cani possono anche ottenere babesiosi e anaplasmosi da punture di zecca e sviluppare IMT come reazione. Un'altra causa possibile è la febbre delle Montagne Rocciose, causata da un batterio trasmesso dalle zecche chiamato Rickettsia rickettsii.
La tularemia è una delle infezioni più comuni che possono causare IMT e non è trasmessa da zecche. A volte viene chiamata febbre da coniglio perché sono un vettore comune, ma molte specie di mammiferi possono essere portatrici. Gli esseri umani possono anche essere colpiti da tularemia.