I lisosomi sono organismi legati da un'unica membrana. I lisosomi producono enzimi idrolitici, che sono proteine catalitiche utilizzate dalle cellule per digerire molecole da antigeni, altri organelli, zuccheri complessi e proteine.
Il processo di digestione inizia quando particelle estranee entrano nella cellula. Gli enzimi rilasciati dai lisosomi abbattono le complesse molecole all'interno di queste particelle. I lisosomi possono anche subire il processo di digestione abbattendo gli organelli cellulari per i nutrienti quando le fonti alimentari sono scarse. L'incapacità dei lisosomi di produrre enzimi specifici o di abbattere particelle estranee è indicativo di gravi condizioni mediche, come la malattia di Tay-Sachs e la malattia di Gaucher.