Il muco è prodotto dalle membrane specializzate che rivestono gli organi delle cavità corporee che si aprono all'esterno, come quelle che si trovano nei sistemi respiratorio, digestivo e riproduttivo. Sebbene il muco sia una secrezione è più comunemente noto per la sua presenza nelle cavità nasali e orali, è anche prodotto nello stomaco, nell'esofago e nelle vescicole seminali maschili. La secrezione di muco svolge un ruolo vitale come mezzo protettivo e di trasporto nelle funzioni interne dell'apparato digerente, respiratorio e riproduttivo dell'uomo e di altri vertebrati.
Il muco prodotto nel sistema respiratorio umano protegge i polmoni limitando le particelle estranee che li raggiungono. Il muco nei passaggi nasali e delle vie aeree intrappola piccoli particolati, come polvere, allergeni e batteri, prima che possano entrare nel sistema. La flemma si riferisce a un tipo specifico di muco che è normalmente limitato al tratto respiratorio. Il muco nasale è prodotto dai tessuti che rivestono gli organi delle vie aeree, come quelli che rivestono la trachea e i bronchioli. Una produzione continua di muco nasale idrata l'aria inalata e impedisce anche alle vie aeree e ai tessuti nasali di seccarsi.
Nel sistema digestivo umano, il muco impedisce alle pareti cellulari dello stomaco di essere danneggiate dall'elevata concentrazione di acido presente nell'organo. L'esofago utilizza il muco come lubrificante per favorire il passaggio del cibo sulla via dello stomaco.
