Alcuni esempi di flagellati includono tripanosomi e Giardia lamblia. Il tripanosoma è un parassita che causa la malattia del sonno quando entra in contatto con un essere umano. La giardia lamblia è anche un parassita e causa angoscia nello stomaco e nell'intestino.
La giardia lamblia si trova tipicamente nei fiumi e nei torrenti di montagna. Altri tipi di flagellati comprendono i dinoflagellati, comunemente trovati come plancton sia in acqua dolce che salata, e euglena, che è un tipo di flagellazione a vita libera. La varietà volvox di flagellate, d'altra parte, si trova tipicamente nei cluster di colonie.
Per qualificarsi come flagellati, l'organismo deve avere un nucleo di una singola cellula e possedere almeno un flagello che viene utilizzato sia per i movimenti che per le sensazioni. Una grande maggioranza di flagellati possiede un rivestimento esterno rigido o un rivestimento che assomiglia alla gelatina. La riproduzione di questi organismi coinvolge sia metodi sessuali che asessuati.
Gli organismi di questa categoria possono essere ulteriormente divisi in due gruppi diversi: fitomastigophorea e zoomastigophorea. I primi sono flagellati che assomigliano alle piante, mentre i secondi ricordano gli animali. I flagellati di Phytomastigophorea sono in grado di produrre cibo usando la fotosintesi. I flagellati di Zoomastigophorea, d'altra parte, si trovano nei tratti digestivi dei piccoli insetti e sono in grado di assorbire i nutrienti dalla cellulosa.
