HPLC, la cromatografia liquida ad alte prestazioni, ha pochissimi svantaggi, ma quelli pochi sono a bassa sensibilità, difficoltà a pulire e i dispositivi sono molto costosi. La funzione, l'uso e la precisione di un dispositivo HPLC sono molto simili a un GC o gascromatografia.
I campioni utilizzati in una macchina per cromatografia liquida ad alte prestazioni sono solitamente più grandi di quelli di una macchina per cromatografia a gas. Nonostante il numero di svantaggi che ha, ci sono anche numerosi vantaggi. I dispositivi sono più precisi di altri dispositivi e possono analizzare una gamma più ampia di composti, sebbene il dispositivo GC possa fare meglio con miscele più complesse rispetto ai dispositivi HPLC.
