I pazienti che ricevono una vaccinazione antinfluenzale sono a rischio di sperimentare effetti collaterali lievi quali dolore, arrossamento o gonfiore della zona interessata, febbre e dolori, secondo il Center for Disease Control. Raramente, le persone possono sperimentare una reazione allergica pericolosa per la vita al vaccino.
I bambini che ricevono il vaccino spray nasale possono sperimentare naso che cola, respiro affannoso, mal di testa, vomito, dolori muscolari e febbre. I pazienti adulti possono presentare naso che cola, mal di testa, mal di gola e tosse dal vaccino spray nasale. La maggior parte delle persone non ha effetti collaterali da entrambi i vaccini; quelli che li presentano immediatamente dopo la vaccinazione per brevi periodi, secondo il Center for Disease Control.